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Registros recuperados : 47 | |
4. | | NARCISO, M. G.; BEVITORI, R.; MELLO, R.; SOUZA, T. L.; MENEZES, I. P. P. Sistema de informação sobre marcadores moleculares e elementos regulatórios. In: CONGRESSO NACIONAL DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS, 1.; SIMPÓSIO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS, 4., 2011, Recife. Biodiversidade e floresta: desafios e perspectivas: anais. Recife: Universidade Católica de Pernambuco, 2011. p. 749-754. Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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6. | | MENEZES, I. P. P.; LIMA, T. H.; BRITO, R. R.; SILVA, J. O.; BARROSO, P. A. V.; HOFFMANN, L. V. Diversidade genética de coleções temáticas de algodoeiro mocó (Gossypium hirsutum raça Marie Galante) do Brasil segundo condições de estresse hídrico e fertilidade do solo. Revista RG News, Brasília, DF, v. 3, n. 2, p. 188, 2017. Edição especial dos anais do 3 Simpósio da Rede de Recursos Genéticos Vegetais do Nordeste, Aracaju, out. 2017. Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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7. | | MENEZES, I. P. P.; LIMA, T. H.; BRITO, R. R.; SILVA, J. O.; BARROSO, P. A. V.; HOFFMANN, L. V. Diversidade genética de coleções temáticas de algodoeiro mocó (Gossypium hirsutum raça Marie Galante) do Brasil segundo condições de estresse hídrico e fertilidade do solo. Revista RG News, Brasília, DF, v. 3, n. 2, p. 188, 2017. Edição especial dos anais do 3 Simpósio da Rede de Recursos Genéticos Vegetais do Nordeste, Aracaju, out. 2017. Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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8. | | MENEZES, I. P. P.; LUCENA, V. S.; PEREIRA, G. S.; ALMEIDA, V. C.; BARROSO, P. A. V.; HOFFMANN, L. V. Diversidade genética e diferenciação de genótipos de Gossypium barbadense e G. hirsutum r. marie-galante do estado do Piauí com base em marcadores SSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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9. | | MENEZES, I. P. P. de; HOFFMANN, L. V.; ALVES, M. F.; MORELLO, C. de L.; BARROSO, P. A. V. Distância genética entre linhagens avançadas de germoplasma de algodão com uso de marcadores de RAPD e microssatélites. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 10, p. 1339-1347, out. 2008. Título em inglês: Genetic distance among advanced lineages of cotton germplasm using RAPD and microsatellite markers. Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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10. | | MENEZES, I. P. P. de; HOFFMANN, L. V.; GAIOTTO, F. A.; CIAMPI, A. Y.; BARROSO, P. A. V. Genética populacional de Gossypium mustelinum presentes no Rio de Contas, Bahia, Brasil. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 6., 2012, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2012. p. 81. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 275). Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Arroz e Feijão. |
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12. | | CAZÉ, A. L. R.; LUCENA, V. S.; MENEZES, I. P. P. de; HOFFMANN, L. V.; RIBEIRO, J. L. Caracterização in situ de populações de Gossypium hirsutum L. e G. barbadense L. (Malvaceae) do Estado do Piauí. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 59.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 31.; CONGRESO LATINOAMERICANO Y DEL CARIBE DE CACTÁCEAS Y OTRAS SUCULENTAS, 4.; CONGRESS OF INTERNATIONAL ORGANIZATION FOR SUCULENT PLANT STUDY, 30., 2008, Natal. Atualidades, desafios e perspectivas da botânica no Brasil: resumos. Natal: UFERSA: UFRN: SBB, 2008. p. 268 Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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13. | | CAZÉ, A. L. R.; LUCENA, V. S.; MENEZES, I. P. P. de; BARROSO, P. A. V.; RIBEIRO, J. L. Avaliação qualitativa in situ dos acessos de algodoeiros coletados no Estado do Maranhão. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 59.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 31.; CONGRESSO LATINOAMERICANO Y DEL CARIBE DE CACTÁCEAS Y OTRAS SUCULENTAS, 4.; CONGRESS OF INTERNATIONAL ORGANIZATION FOR SUCULENT PLANT STUDY, 30., 2008, Natal. Atualidades, desafios e perspectivas da botânica no Brasil: resumos. Natal: UFERSA: UFRN: SBB, 2008. p. 221 Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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14. | | CAZÉ, A. L. R.; LUCENA, V. S.; MENEZES, I. P. P. de; BARROSO, P. A. V.; RIBEIRO, J. L. Avaliação qualitativa in situ dos acessos de algodoeiros coletados no Estado do Maranhão. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 59.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 31.; CONGRESSO LATINOAMERICANO Y DEL CARIBE DE CACTÁCEAS Y OTRAS SUCULENTAS, 4.; CONGRESS OF INTERNATIONAL ORGANIZATION FOR SUCULENT PLANT STUDY, 30., 2008, Natal. Atualidades, desafios e perspectivas da botânica no Brasil: resumos. Natal: UFERSA: UFRN: SBB, 2008. Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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17. | | PRADO, G. S.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Análise da diversidade genética de variedades tradicionais de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 7., 2013, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2013. p. 48. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 292). Pôster - graduação. Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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18. | | MÜLLER, B. S. de F.; SAKAMOTO, T.; MENEZES, I. P. P. de; PRADO, G. S.; MARTINS, W. S.; BRONDANI, C.; BARROS, E. G. de; VIANELLO, R. P. Analysis of BAC-end sequences in common bean (Phaseolus vulgaris L.) towards the development and characterization of long motifs SSRs. Plant Molecular Biology, Dordrecht, v. 86, n. 4/5, p. 455-470, Nov. 2014. Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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19. | | MOTA, A. P. S.; MENEZES, I. P. P. de; SOUZA, T. L. P. O. de; FARIA, J. C. de; VIANELLO, R. P. Análise de SSRs para retrocruzamento assistido visando introgressão do transgene de resistência ao VMDF. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 6., 2012, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2012. p. 16. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 275). Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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20. | | CARDOSO, P. C. B.; BRONDANI, C.; MENEZES, I. P. P.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. O.; DEL PELOSO, M. J.; VIANELLO, R. P. Discrimination of common bean cultivars using multiplexed microsatellite markers. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 1, p. 1964-1978, 2014. Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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Registros recuperados : 47 | |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Arroz e Feijão. Para informações adicionais entre em contato com cnpaf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
Data corrente: |
01/09/2014 |
Data da última atualização: |
09/12/2014 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
MÜLLER, B. S. de F.; SAKAMOTO, T.; MENEZES, I. P. P. de; PRADO, G. S.; MARTINS, W. S.; BRONDANI, C.; BARROS, E. G. de; VIANELLO, R. P. |
Afiliação: |
BÁRBARA SALOMÃO DE FARIA MÜLLER, UFV; TETSU SAKAMOTO, UFMG; IVANDILSON PESSOA PINTO DE MENEZES, INSTITUTO FEDERAL GOIANO, Urutaí-GO; GUILHERME SOUZA PRADO, bolsista CNPAF; WELLINGTON SANTOS MARTINS, UFG; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; EVERALDO GONÇALVES DE BARROS, UNIVERSIDADE CATÓLICA DE BRASÍLIA; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
Título: |
Analysis of BAC-end sequences in common bean (Phaseolus vulgaris L.) towards the development and characterization of long motifs SSRs. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology, Dordrecht, v. 86, n. 4/5, p. 455-470, Nov. 2014. |
DOI: |
10.1007/s11103-014-0240-7 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The increasing volume of genomic data on the Phaseolus vulgaris species have contributed to its importance as a model genetic species and positively affected the investigation of other legumes of scientific and economic value. To expand and gain a more in-depth knowledge of the common bean genome, the ends of a number of bacterial artificial chromosome (BAC) were sequenced, annotated and the presence of repetitive sequences was determined. In total, 52,270 BESs (BAC-end sequences), equivalent to 32 Mbp (~6 %) of the genome, were processed. In total, 3,789 BES-SSRs were identified, with a distribution of one SSR (simple sequence repeat) per 8.36 kbp and 2,000 were suitable for the development of SSRs, of which 194 were evaluated in low-resolution screening. From 40 BES-SSRs based on long motifs SSRs (≥trinucleotides) analyzed in high-resolution genotyping, 34 showed an equally good amplification for the Andean and for the Mesoamerican genepools, exhibiting an average gene diversity (H E) of 0.490 and 5.59 alleles/locus, of which six classified as Class I showed a H E ≥ 0.7. The PCoA and structure analysis allowed to discriminate the gene pools (K = 2, FST = 0.733). From the 52,270 BESs, 2 % corresponded to transcription factors and 3 % to transposable elements. Putative functions for 24,321 BESs were identified and for 19,363 were assigned functional categories (gene ontology). This study identified highly polymorphic BES-SSRs containing tri- to hexanucleotides motifs and bringing together relevant genetic characteristics useful for breeding programs. Additionally, the BESs were incorporated into the international genome-sequencing project for the common bean. MenosThe increasing volume of genomic data on the Phaseolus vulgaris species have contributed to its importance as a model genetic species and positively affected the investigation of other legumes of scientific and economic value. To expand and gain a more in-depth knowledge of the common bean genome, the ends of a number of bacterial artificial chromosome (BAC) were sequenced, annotated and the presence of repetitive sequences was determined. In total, 52,270 BESs (BAC-end sequences), equivalent to 32 Mbp (~6 %) of the genome, were processed. In total, 3,789 BES-SSRs were identified, with a distribution of one SSR (simple sequence repeat) per 8.36 kbp and 2,000 were suitable for the development of SSRs, of which 194 were evaluated in low-resolution screening. From 40 BES-SSRs based on long motifs SSRs (≥trinucleotides) analyzed in high-resolution genotyping, 34 showed an equally good amplification for the Andean and for the Mesoamerican genepools, exhibiting an average gene diversity (H E) of 0.490 and 5.59 alleles/locus, of which six classified as Class I showed a H E ≥ 0.7. The PCoA and structure analysis allowed to discriminate the gene pools (K = 2, FST = 0.733). From the 52,270 BESs, 2 % corresponded to transcription factors and 3 % to transposable elements. Putative functions for 24,321 BESs were identified and for 19,363 were assigned functional categories (gene ontology). This study identified highly polymorphic BES-SSRs containing tri- to hexanucleotides mo... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Feijão; Genética molecular; Phaseolus vulgaris. |
Thesaurus NAL: |
Beans; Fabaceae; Genomics; Microsatellite repeats; Molecular genetics; Transcription factors; Transposons. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
Marc: |
LEADER 02734naa a2200337 a 4500 001 1993888 005 2014-12-09 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11103-014-0240-7$2DOI 100 1 $aMÜLLER, B. S. de F. 245 $aAnalysis of BAC-end sequences in common bean (Phaseolus vulgaris L.) towards the development and characterization of long motifs SSRs.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aThe increasing volume of genomic data on the Phaseolus vulgaris species have contributed to its importance as a model genetic species and positively affected the investigation of other legumes of scientific and economic value. To expand and gain a more in-depth knowledge of the common bean genome, the ends of a number of bacterial artificial chromosome (BAC) were sequenced, annotated and the presence of repetitive sequences was determined. In total, 52,270 BESs (BAC-end sequences), equivalent to 32 Mbp (~6 %) of the genome, were processed. In total, 3,789 BES-SSRs were identified, with a distribution of one SSR (simple sequence repeat) per 8.36 kbp and 2,000 were suitable for the development of SSRs, of which 194 were evaluated in low-resolution screening. From 40 BES-SSRs based on long motifs SSRs (≥trinucleotides) analyzed in high-resolution genotyping, 34 showed an equally good amplification for the Andean and for the Mesoamerican genepools, exhibiting an average gene diversity (H E) of 0.490 and 5.59 alleles/locus, of which six classified as Class I showed a H E ≥ 0.7. The PCoA and structure analysis allowed to discriminate the gene pools (K = 2, FST = 0.733). From the 52,270 BESs, 2 % corresponded to transcription factors and 3 % to transposable elements. Putative functions for 24,321 BESs were identified and for 19,363 were assigned functional categories (gene ontology). This study identified highly polymorphic BES-SSRs containing tri- to hexanucleotides motifs and bringing together relevant genetic characteristics useful for breeding programs. Additionally, the BESs were incorporated into the international genome-sequencing project for the common bean. 650 $aBeans 650 $aFabaceae 650 $aGenomics 650 $aMicrosatellite repeats 650 $aMolecular genetics 650 $aTranscription factors 650 $aTransposons 650 $aFeijão 650 $aGenética molecular 650 $aPhaseolus vulgaris 700 1 $aSAKAMOTO, T. 700 1 $aMENEZES, I. P. P. de 700 1 $aPRADO, G. S. 700 1 $aMARTINS, W. S. 700 1 $aBRONDANI, C. 700 1 $aBARROS, E. G. de 700 1 $aVIANELLO, R. P. 773 $tPlant Molecular Biology, Dordrecht$gv. 86, n. 4/5, p. 455-470, Nov. 2014.
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